MICRO-ORGANISMES COMPATIBLES
De par son rôle dans l’immunité innée, la protéine ApoH peut accrocher un large panel d’éléments du non soi, notamment les virus et les bactéries.
Cependant il faut garder à l’esprit que l’ApoH a plus d’affinité pour les micro-organismes infectieux. Ainsi, il est recommandé de ne pas inactiver les virus avant le contact avec l’ApoH et d’éviter l’utilisation de bactéries ayant perdues leur virulence (bactéries de collection) dont certaines affichent des rendements de capture limités. De la même façon, un échantillon mal conservé peut entraîner une dégradation de la surface du micro-organisme, empêchant ainsi toute interaction avec l’ApoH.
Les bactéries
La sensibilité du kit de capture des bactéries permet de travailler directement sur l’échantillon, sans attendre une phase de pré-enrichissement par culture (ex : hémoculture).
Des tests avec S. aureus dans du sang EDTA nous ont révélé une sensibilité de 1 CFU / 5 mL de sang.
Un tel résultat permet un gain de temps considérable, débouchant sur une meilleure gestion de l’infection.
Liste non-exhaustive des bactéries (et levures) ayant montré une interaction avec l’ApoH ou le Peps6
| Acinetobacter baumannii | Corynebacterium sp. | Mycobacterium abscessus | Salmonella typhimurium |
| Acinetobacter lwoffii | Corynebacterium xerosis | Mycobacterium chelonae | Serratia marcescens |
| Acinetobacter sp. | Enterobacter aerogenes | Neisseria cinerea | Sphingomonas paucimobilis |
| Bacillus cereus | Enterobacter cloacae | Nocardia farcinica | Staphylococcus aureus |
| Bacillus sp. | Enterococcus faecalis | Ocrobactrum anthropi | Staphylococcus epidermidis |
| Bacillus subtilis | Enterococcus faecium | Parabacteroides distasonis | Staphylococcus haemolyticus |
| Bacteroïdes fragilis | Enterococcus gallinarum | Porphyromonas endodontalis | Staphylococcus hominis |
| Bacteroides ureolyticus | Escherichia coli | Propionibacterium acnes | Stenotrophomonas maltophilia |
| Campylobacter fetus | Fusobacterium nucleatum | Proteus mirabilis | Streptococcus agalactiae |
| Candida albicans | Fusobacterium sp. | Proteus vulgaris | Streptococcus bovis |
| Capnocytophaga canimosus | Klebsiella oxytoca | Providencia stuartii | Streptococcus D group |
| Chlamydia trachomatis | Klebsiella pneumoniae | Pseudomonas aeruginosa | Streptococcus mitis |
| Citrobacter freundi | Legionella pneumophila | Pseudomonas sp. | Streptococcus parasanguinis |
| Citrobacter koseri | Listeria sp. | Pseudomonas stutzeri | Streptococcus pneumoniae |
| Clostridium difficile | Micrococcus luteus | Salmonella arizonae | Streptococcus pyogenes |
| Clostridium perfringens | Micrococcus sp. | Salmonella enteritidis | Tropheryma whipplei |
| Corynebacterium ammoniagenes | Mycobacter sp. | Vibrio cholerae |
De nombreuses bactéries parmi celles énumérées ci-dessus ont été testées à partir d’hémoculture.
Le pré-traitement de 156 hémocultures par ApoH a permis de repérer et de résoudre 13,6% de cas « faux négatifs ».
Ces résultats s’expliquent notamment par l’utilisation d’un volume plus important de l’échantillon pour l’analyse, grâce à l’effet de concentration des billes, et par une élimination des inhibiteurs, apportée par les étapes de lavage après la capture des bactéries sur les billes.
Les virus
Les nombreuses collaborations et la finalisation du projet européen USDEP (Ultra Sensitive Detection of Emergent Pathogens) nous ont permis de valider les qualités du kit de capture sur un grand nombre de virus. Cette méthode a été prouvée son efficacité sur des virus enveloppés ou non-enveloppés à ADN ou ARN.
Liste non-exhaustive des virus ayant montré une interaction avec l’ApoH ou le Peps6
| Virus Humain | Virus animal ou végétal | |
| Virus à ADN | Virus à ARN | |
| Adénovirus | VIH | Parvovirus Porcin PPV |
| Epstein-Barr Herpès HHV-4 Pseudorage | Rotavirus, Mammalian orthoreovirus 3 | Nécrose Pancréatique Infectieuse du Saumon IPNV Anémie Infectieuse du Saumon ISAV |
| Herpès de l’huître : OsHV-1 | ||
| Orthopox Vaccinia, Callpox | Grippe : H1N1, H3N2, H3N3, Yamagata-like (Floride), Victoria-like (Malaisie) | Aphtovirus : Fièvre aphteuse FMD A5, O1, C, Asia, Sat1, Sat2, Sat3 Entérovirus : picornavirus, maladie vésiculeuse du porc |
| Rétrovirus endogène HERV-K, HERV-W, MSRV | Dengue, Hépatite C, virus du Nil occidental, Fièvre jaune | Virus porcin du syndrome reproducteur et respiratoire (PRRSV) Syndrome dysgénésique et respiratoire porcin « oreilles bleues » |
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| Norovirus de souris ou de singe MNV, Tulane | |
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| Ebola Marburg | Rabdhovirus de stomatite vésiculaire New Jersey, Indiana1 |
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| Lassa | Diarrhée Virale Bovine |
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| Virus respiratoire syncytial humain | Baculovirus de l'enroulement de la vigne GRLaV-1 et 3 |
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| Pseudorage |
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| Fièvre catarrhale Reovirus Bluetongue 2, 8 |
